Hướng dẫn sử dụng pca column

Giải ham mê từng bước về PCA bởi pyeo hẹp với ví dụ

Phân tích nguyên tố bao gồm hoặc PCA là một trong những kỹ thuật được áp dụng rộng thoải mái nhằm giảm form size của tập tài liệu bự. Việc giảm số lượng các nguyên tố hoặc tuấn kiệt tiêu hao một số trong những độ chính xác và còn mặt khác, nó làm cho tập dữ liệu béo đơn giản và dễ dàng hơn, dễ mày mò cùng trực quan liêu. Hình như, nó làm cho bớt độ phức hợp tính toán thù của quy mô, góp các thuật toán thù học lắp thêm chạy nhanh hơn. Nó luôn là một câu hỏi với tranh cãi xung đột về độ đúng đắn mà nó buộc phải hy sinh để sở hữu được cỗ tài liệu thiết bị nguim không nhiều tinh vi hơn và giảm sút. chúng tôi không tồn tại câu vấn đáp thắt chặt và cố định cho điều đó, mặc dù chúng tôi cố gắng giữ lại hầu như pmùi hương sai trong những khi lựa chọn tập phù hợp nguyên tố cuối cùng.

Bạn đang xem: Hướng dẫn sử dụng pca column

Trong nội dung bài viết này, chúng ta đã bàn thảo về cách tiếp cận mỗi bước nhằm có được việc sút form size bởi PCA cùng sau đó tôi cũng biến thành chỉ ra rằng biện pháp chúng ta có thể triển khai tất cả vấn đề này bằng phương pháp thực hiện thư viện pydong dỏng.

Các bước liên quan đến PCA Chuẩn hóa dữ liệu. (với cái giá trị mức độ vừa phải = 0 và phương sai = 1) Tính toán thù ma trận Phương sai của những thiết bị nguyên ổn. Lấy Eigenvectors cùng Eigenvalues ​​từ ma trận hiệp phương không đúng (bọn họ cũng rất có thể sử dụng ma trận đối sánh hoặc thậm chí còn phân tung cực hiếm đơn, tuy vậy trong bài xích đăng này đang tập trung vào ma trận hiệp pmùi hương sai). Sắp xếp những cực hiếm riêng theo thiết bị tự bớt dần dần và chọn k Giá trị riêng rẽ hàng đầu tương xứng với k quý giá riêng biệt lớn số 1 (k đang biến số kích thước của không khí nhỏ đối tượng mới k≤d, d là số form size ban đầu). Xây dựng ma trận chiếu W từ k Sở sửa đổi đang lựa chọn. Biến đổi tập tài liệu lúc đầu X qua W nhằm nhận được không khí nhỏ Y đặc thù k-chiều mới.

import pandas as pd import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.decomposition import PCA from sklearn.preprocessing import standardScaler %matplotlib inlinedf = pd.read_csv( filepath_or_buffer="https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/iris/iris.data", header=None, sep=",") df.columns=<"sepal_len", "sepal_wid", "petal_len", "petal_wid", "class"> print(df.isnull().values.any()) df.dropna(how="all", inplace=True) # drops the empty line at file-end #if inplace = False then we have lớn assign back khổng lồ dataframe as it is a copy #df = df.some_operation(inplace=False) #No need to assign bachồng lớn dataframe when inplace = True #df.some_operation(inplace=True) #Print Last five rows. df.tail()

*

1. Tiêu chuẩn hóa

khi có những thang đo khác biệt được áp dụng để đo cực hiếm của các đối tượng người dùng địa lý, thì nên tiến hành chuẩn chỉnh hóa để mang tất cả các không gian đối tượng người sử dụng địa lý có mức giá trị mức độ vừa phải = 0 và pmùi hương không nên = 1.

Lý chính bới sao tiêu chuẩn hóa là hết sức quan trọng trước khi tiến hành PCA là PCA rất nhạy cảm cùng với các phương thơm sai. có nghĩa là, nếu tất cả sự khác hoàn toàn phệ thân những thang (phạm vi) của các đối tượng người sử dụng địa lý, thì những đối tượng bao gồm đồ sộ lớn hơn đang chiếm ưu cố gắng hơn đa số đối tượng người tiêu dùng bao gồm quy mô nhỏ.

Ví dụ: một đối tượng người dùng ở trong vòng tự 0 mang đến 100 đang chiếm ưu cố kỉnh đối với đối tượng người tiêu dùng ở trong tầm từ bỏ 0 mang lại 1 với nó vẫn dẫn mang đến kết quả sai lệch. Vì vậy, Việc biến hóa dữ liệu lịch sự những thang đo giống như nhau đã ngăn ngừa được vụ việc này. Đó là khu vực Shop chúng tôi áp dụng tiêu chuẩn hóa để lấy các đối tượng người sử dụng địa lý có mức giá trị vừa đủ 0 cùng phương thơm sai 1.

Vì vậy, đây là công thức để tính giá trị chuẩn hóa của những đối tượng người dùng địa lý:


*

Trong nội dung bài viết này, tôi đã thực hiện tập tài liệu Iris. Mặc cho dù toàn bộ những bản lĩnh vào tập dữ liệu Iris hồ hết được đo bởi đơn vị chức năng centimet, tuy nhiên tôi vẫn sẽ tiếp tục biến đổi tài liệu lên thang đơn vị chức năng (vừa đủ = 0 và pmùi hương không đúng = 1), đấy là thử dùng để có được công suất tối ưu của đa số thuật toán học tập lắp thêm . Ngoài ra, nó sẽ giúp chúng tôi phát âm cách thức hoạt động vui chơi của quy trình này.

from sklearn.preprocessing import StandardScaler X_std = StandardScaler().fit_transform(X)


*

2. Phân tan Eiren - Máy tính Eigenvectors cùng Eigenvalues

Các giá trị riêng rẽ cùng cực hiếm riêng của ma trận hiệp pmùi hương không nên (hoặc tương quan) đại diện cho “cốt lõi” của PCA:

Các Eigenvectors (những nhân tố chính) xác kim chỉ nan của không gian đối tượng người sử dụng new và những giá trị riêng biệt khẳng định độ lớn của bọn chúng. Nói phương pháp khác, các giá trị riêng rẽ lý giải phương thơm không đúng của tài liệu dọc từ các trục tính năng vượt trội. Nó Tức là quý hiếm riêng rẽ tương xứng đến họ biết rằng gồm bao nhiêu phương không đúng được bao hàm trong đối tượng người dùng địa lý bắt đầu được biến đổi đó. Để dành được cực hiếm riêng và Giá trị riêng biệt, họ đề xuất tính toán thù ma trận hiệp phương thơm sai. Vì vậy, trong bước tiếp theo, hãy tính toán thù nó.

Cách tiếp cận cổ điển so với PCA là thực hiện phân tan Eiren bên trên ma trận hiệp phương sai Σ, là ma trận ad × d trong đó từng bộ phận thay mặt đến hiệp phương không nên thân hai đối tượng người sử dụng. Lưu ý, d là số kích cỡ ban sơ của tập tài liệu. Trong tập tài liệu Iris, bọn họ gồm 4 đặc trưng cho nên vì vậy ma trận hiệp pmùi hương không đúng sẽ có bậc 4 × 4.

#mean_vec = np.mean(X_std, axis=0) #cov_mat = (X_std - mean_vec).T.dot((X_std - mean_vec)) / (X_std.shape<0>-1) #print("Covariance matrix %s" %cov_mat) print("Covariance matrix ") cov_mat= np.cov(X_std, rowvar=False) cov_mat

Tại trên đây nếu như bọn họ biết những tư tưởng về Đại số con đường tính cùng cách tính toán thù Eigenvectors với Eigenvalues ​​của ma trận thì vấn đề này sẽ tương đối có ích vào việc đọc những tư tưởng sau đây. Vì vậy, Cửa Hàng chúng tôi khuyên chúng ta nên đi qua một số trong những tư tưởng cơ phiên bản của Đại số tuyến đường tính nhằm phát âm sâu hơn về kiểu cách các sản phẩm vận động.

Ở đây tôi đã áp dụng mảng numpy nhằm tính toán thù Eigenvectors cùng Eigenvalues ​​của những cực hiếm không khí đối tượng người sử dụng tiêu chuẩn nlỗi sau:

cov_mat = np.cov(X_std.T) eig_vals, eig_vecs = np.linalg.eig(cov_mat) print("Eigenvectors %s" %eig_vecs) print(" Eigenvalues %s" %eig_vals)

Như chúng ta hiểu được tổng bình phương thơm của mỗi giá trị trong một Eigenvector là một trong những. Vì vậy, hãy coi nếu nó đúng tức là họ đang tính toán thù Eigenvector một phương pháp đúng đắn.

Xem thêm: Chương 5 Những Vấn Đề Cơ Bản Về Tỷ Giá, Chương 3: Những Vấn Đề Cơ Bản Về Tỷ Giá

sq_eig=<> for i in eig_vecs: sq_eig.append(i**2) print(sq_eig) sum(sq_eig) print("sum of squares of each values in an eigene vector is ", 0.27287211+ 0.13862096+0.51986524+ 0.06864169) for ev in eig_vecs: np.testing.assert_array_almost_equal(1.0, np.linalg.norm(ev))

Mục tiêu điển hình nổi bật của PCA là sút size của không khí đặc thù ban sơ bằng cách chiếu nó lên một không khí nhỏ nhỏ dại rộng, chỗ các eigenvector sẽ tạo thành những trục. Tuy nhiên, các cỗ chỉnh hình chỉ khẳng định những hướng của trục new, vì chưng bọn chúng bao gồm cùng độ nhiều năm đơn vị chức năng 1.

Ý tưởng ngơi nghỉ đó là bằng cách chọn k đầu, họ sẽ đưa ra quyết định rằng pmùi hương không đúng tương xứng với k không khí đặc trưng đó là đủ để thể hiện tập dữ liệu. Và bằng phương pháp làm mất phương thơm sai sót lại của các tác dụng ko được lựa chọn kia, sẽ không còn làm mất đi độ đúng chuẩn các hoặc Shop chúng tôi có thể bỏ trải qua nhiều độ đúng đắn mà ngân sách vày pmùi hương sai bị làm lơ.

Vì vậy, đây là quyết định nhưng mà chúng tôi bắt buộc giới thiệu dựa vào sự việc đặt ra với cũng dựa vào trường vừa lòng sale. Không bao gồm luật lệ hoàn hảo nhất nhằm đưa ra quyết định nó.

Bây giờ đồng hồ chúng ta hãy khám phá các thành phần chủ yếu bởi công việc sau:

3.1 Sắp xếp những quý giá riêng

Để đưa ra quyết định (các) Eigenvector nào hoàn toàn có thể được loại trừ cơ mà ko làm mất không ít ban bố đến bài toán xây cất không khí bé chiều phải chăng hơn, họ nên soát sổ những quý hiếm riêng rẽ tương ứng:

Các Eigenvectors có giá trị riêng tốt tốt nhất tất cả không nhiều lên tiếng duy nhất về việc phân păn năn dữ liệu; chính là những chiếc có thể bị quăng quật. Để có tác dụng những điều đó, biện pháp tiếp cận thịnh hành là xếp thứ hạng các quý hiếm riêng biệt trường đoản cú cao nhất đến thấp tốt nhất để lựa chọn k Eigenvectors bậc nhất.

#Make a các mục of (eigenvalue, eigenvector) tuples eig_pairs = <(np.abs(eig_vals), eig_vecs<:,i>) for i in range(len(eig_vals))> print(type(eig_pairs)) #Sort the (eigenvalue, eigenvector) tuples from high lớn low eig_pairs.sort() eig_pairs.reverse() print(" ",eig_pairs) #Visually confirm that the danh mục is correctly sorted by decreasing eigenvalues print(" Eigenvalues in descending order:") for i in eig_pairs: print(i<0>)

Sau Lúc bố trí những cặp eigenpairs, câu hỏi tiếp sau là "bọn họ đang lựa chọn từng nào yếu tắc bao gồm cho không gian nhỏ tính năng mới của mình?" Một thước đo có ích là chiếc Call là "phương không đúng giải thích", có thể được tính toán tự những giá trị riêng rẽ. Phương không nên được giải thích mang đến họ biết có bao nhiêu thông báo (pmùi hương sai) có thể được quy cho từng nhân tố thiết yếu.

tot = sum(eig_vals) print(" ",tot) var_exp = <(i / tot)*100 for i in sorted(eig_vals, reverse=True)> print(" 1. Variance Explained ",var_exp) cum_var_exp = np.cumsum(var_exp) print(" 2. Cumulative sầu Variance Explained ",cum_var_exp) print(" 3. Percentage of variance the first two principal components each contain ",var_exp<0:2>) print(" 4. Percentage of variance the first two principal components together contain ",sum(var_exp<0:2>))

Ma trận chiếu sẽ được áp dụng để biến đổi tài liệu Iris vào không gian nhỏ của đối tượng địa lý bắt đầu hoặc chúng ta nói tập dữ liệu mới được chuyển đổi với size bớt. Nó là 1 ma trận của k Eigenvector bậc nhất được ghép nối của chúng ta.

print(eig_pairs<0><1>) print(eig_pairs<1><1>) matrix_w = np.hstack((eig_pairs<0><1>.reshape(4,1), eig_pairs<1><1>.reshape(4,1))) #hstack: Stacks arrays in sequence horizontally (column wise). print("Matrix W: ", matrix_w)

Trong bước cuối cùng này, Cửa Hàng chúng tôi đang áp dụng ma trận chiếu 4 × 2D W để chuyển đổi chủng loại của Cửa Hàng chúng tôi lịch sự không gian nhỏ mới thông qua phương trình Y = X × W, trong đó ma trận Áp sạc ra Y đang là ma trận 150 × 2 của các chủng loại vẫn biến hóa của công ty chúng tôi .

Y = X_std.dot(matrix_w) principalDf = pd.DataFrame(data = Y , columns = <"principal component 1", "principal component 2">) principalDf.head()

Sử dụng phnghiền chiếu PCA thành 2d nhằm trực quan liêu hóa toàn cục tập dữ liệu. quý khách hàng bắt buộc vẽ các lớp khác biệt bằng phương pháp sử dụng các Color hoặc hình trạng không giống nhau. Các lớp học nên được phân cách xuất sắc với nhau.

fig = plt.figure(figkích thước = (8,5)) ax = fig.add_subplot(1,1,1) ax.set_xlabel("Principal Component 1", fontsize = 15) ax.set_ylabel("Principal Component 2", fontform size = 15) ax.set_title("2 Component PCA", fontform size = 20) targets = <"Iris-setosa", "Iris-versicolor", "Iris-virginica"> colors = <"r", "g", "b"> for target, color in zip(targets,colors): indicesToKeep = finalDf<"species"> == target ax.scatter(finalDf.loc , finalDf.loc , c = color , s = 50) ax.legend(targets) ax.grid()

Ngoài ra, tất cả những tlỗi viện thẳng trong pynhỏ nhắn tính tân oán thẳng những nhân tố chính và không đề xuất thực hiện toàn bộ những phnghiền tính trên. Các bước được nói ở bên trên cung ứng cho chính mình sự phát âm biết về phong thái mọi thứ vận động.

pca = PCA(n_components=2) # Here we can also give sầu the percentage as a paramter khổng lồ the PCA function as pca = PCA(.95). .95 means that we want lớn include 95% of the variance. Hence PCA will return the no of components which describe 95% of the variance. However we know from above computation that 2 components are enough so we have passed the 2 components.principalComponents = pca.fit_transform(X_std) principalDf = pd.DataFrame(data = principalComponents , columns = <"principal component 1", "principal component 2">)principalDf.head(5) # prints the top 5 rows

Vì vậy, chính là tất cả về Phân tích yếu tố bao gồm. Trong bài xích đăng tiếp theo của tôi, tôi sẽ viết về kiểu cách PCA tăng tốc những Thuật toán Học sản phẩm và tiến hành phân tích đối chiếu gồm cùng không có PCA.

Hy vọng nó sẽ giúp bạn nắm rõ về tư tưởng phía sau PCA. Hãy share suy nghĩ / phát minh của bạn bằng cách sử dụng phần phản hồi bên dưới. quý khách hàng cũng rất có thể liên hệ cùng với tôi bằng Liên kết Liên hệ .

Xem thêm: Cách Làm Kem Để Trang Trí Bánh, Làm Kem Cream Cheese Trang Trí Bánh

Được xuất bản thứ 1 tại http://ashutoshtripathi.com vào ngày 11 mon 7 năm 2019.


Japanese Spanish German French Tnhì Portuguese Russian Vietnamese Italian Korean Turkish Indonesian Polish Hindi
*

Đây là nỗ lực cố gắng của mình nhằm giải thích xuất sắc hơn sự giao thoa giữa toán thù học, sinh học tập và kỹ thuật máy tính. Hầu không còn các ví dụ nghiêm ngặt được thực hiện nhằm hiểu trong bài bác báo là vào sách của Pavel Pevzner và Phillip Compeau, mà lại được tôi định dạng cùng mở rộng.


*

Đó là một trong vấn đề hay: Điều gì vẫn xảy ra nếu tổ chức triển khai của người sử dụng dấn được không ít ý kiến ​​đóng góp của người theo dõi cùng nhu cầu thông tin hơn mức bạn có thể xử lý? Quý Khách không thích treo cổ băn khoăn lo lắng trước công bọn chúng (đặc biệt là lúc gồm thiên tai, thông tin nóng giãy hoặc đại dịch). Nhưng chúng ta cũng ko có tác dụng để đội của mình làm việc ko hoàn thành ngủ.


Tính xác suất là ý tưởng để khẳng định tình huống hoặc trò nghịch mang cả bằng cách phát triển trực giác về phần đa gì tạo thành thành cực hiếm đồng tiền trong kết quả. Trực giác bị ảnh hưởng vì chưng biến đổi thể với không bao giờ thay đổi, cùng theo thời hạn lặp đi tái diễn cùng đệ quy, vì thế trò đùa hoặc trường hợp có thể lộ diện không xác định.


Gian lận tiền điện tử sút nhưng lại các vụ hachồng liên quan mang lại DeFi tăng vọt vào khoảng thời gian 2020

Mặc dù tù hãm chi phí điện tử vẫn bớt 57% xuống còn 1,9 tỷ đô la vào năm 2020, nhưng mà Defi chiếm một ít tổng thể vụ trộm vào khoảng thời gian 20đôi mươi, tổng trị giá bán 129 triệu đô la

Tôi sẽ chỉ bắt đầu trường đoản cú chỗ tôi sẽ còn lại trong nội dung bài viết vừa mới đây của tớ về Việc các ban ngành công dụng Toàn cầu cách xử lý ứng dụng ô nhiễm nguy nan tuyệt nhất. Nlỗi tôi vẫn nói sinh hoạt kia, những người dân chơi bất thiết yếu tất cả kinh nghiệm nổi lên theo những cách sáng ý và bất ngờ.


Trong giải đáp này, công ty chúng tôi đã tích hợp một số chỉ báo kỹ thuật thịnh hành độc nhất vô nhị vào bot thanh toán giao dịch Bitcoin của chúng tôi để giúp đỡ nó tò mò những ra quyết định giỏi rộng trong lúc thực hiện những giao dịch auto bên trên thị phần. Trong các gợi ý trước đây của mình, Shop chúng tôi sẽ chế tạo Môi trường thiết lập pythuôn để giao dịch thanh toán Bitcoin, Cửa Hàng chúng tôi đã viết một tác nhân Học bức tốc để gia công điều này.


7 mối quyên tâm với ý niệm sai trái thông dụng về Bitcoin

Những điều khiến các bạn khó khăn với tại vì sao chúng ta có thể ao ước để ý lại

Tôi ko quan tâm tới việc ttiết phục chúng ta đầu tư vào Bitcoin. Tất cả họ đều phải có sở thích rứa hữu đối với rủi ro khủng hoảng và bình yên, chưa kể tới sự hoài nghi về các tinh tế của quả đât hiện đại.


"Dưới sàn Địa Trung Hải": quý khách hàng gái của Thuyền trưởng Sandy bật mý cô ấy sẽ không còn xuất hiện trên "America"s Got Talent"


Đội trưởng Sandy của The Deông chồng Địa Trung Hải đã chia sẻ rằng bạn nữ của cô ấy ấy là Leah Shafer sẽ không còn xuất hiện trên "America"s Got Talent".


Chuyên mục: Kiến thức